Öğretim üyesi olduğu 2012 yılından, matematik bölümü öğrencilerinden F.N.G.’nin başörtülü olması nedeniyle okula girmesini engelleyerek ‘eğitim öğrenim hakkını ihlal ettiği’ gerekçesiyle 2 yıl 1 ay hapse çarptırılan ve cezası Yargıtayca onandıktan sonra cezaevine giren Prof. Dr. Esat Rennan Pekünlü'ye avukatlardan destek geldi. İzmir Adliyesi önünde, yaklaşık yüz avukat toplandı. Denizli Barosu'nun da altına imza koyduğu Türkiye Barolar Birliği, İzmir Barosu, İstanbul Barosu, Ankara Barosu, Tekirdağ Barosu, Artvin Barosu, Balıkesir Barosu, Aydın Barosu, Muğla Barosu, Bursa Barosu ve Yargıçlar Sendikası'nın ortak açıklaması okundu. 

HUKUK DEVLETİ KAVRAMINA ZARAR VERİLDİ
Yaşanan durumu üzüntüyle karşıladıklarını belirten Denizli Baro Başkanı Müjdat İlhan, imza koydukları açıklamayı şu ifadelerle paylaştı, "Mahkemesi kararları çerçevesinde Anayasa hükümlerinin uygulanması için çaba gösteren bir akademisyenin cezaevine gönderilmiş olması, Türkiye Cumhuriyeti'nin temel niteliklerinden olan 'hukuk devleti' kavramına zarar vermiştir. Artık Türkiye Cumhuriyeti'nin 'hukuk devleti' olma iddiası son derece şüphelidir. Türkiye'nin en önemli astronomi profesörlerinden, sayılı bilim adamlarımızdan Prof. Dr. Pekünlü'nün bir 'düşman ceza hukuku-intikam hukuku' uygulaması ile cezaevine atılmış olması, üniversite kavramına ve aydınlanma mücadelesine bir darbe vurmak amacı taşımaktadır'' dedi.